學校完整準確全面貫徹新時代黨的治疆方略，牢牢扭住社會穩定和長治久安總目標，始終堅持“立足兵團、服務新疆、面向全國、輻射中亞”的辦學定位和“以服務為宗旨，在貢獻中發展”的辦學理念，形成了“以兵團精神育人，為維穩戍邊服務”的辦學特色，成為教育戍邊、科技強邊、文化固邊的重要力量。目前，石河子大學正朝著建設西部一流、國際知名的有特色高水平大學目標邁進。
學校有黨政機構20個，群團組織2個，教學機構26個，教輔機構11個，科研機構6個，附屬單位5個。
學?，F有經濟學、法學、教育學、文學、歷史學、理學、工學、農學、醫學、管理學、藝術學、交叉學科12大學科門類。
學校有99個本科專業（招生專業90個）（28個國家一流專業建設點、20個省級一流專業建設點）、13個一級學科博士學位授權點（應用經濟學、生物學、化學、機械工程、化學工程與技術、農業工程、食品科學與工程、作物學、園藝學、畜牧學、基礎醫學、藥學、工商管理學）、2個博士專業學位授權點（機械、土木水利）、32個一級學科碩士學位授權點、36個碩士專業學位授權點。8個博士后科研流動站、2個博士后科研工作站?，F有國家一流建設學科1個（化學工程與技術）、國家重點學科1個（作物栽培學與耕作學）、部省合建學科群2個（化學工程與技術、農業工程），兵團重點學科15個。臨床醫學、農業科學、化學、植物與動物科學、工程學、材料科學、環境/生態學、藥理學與毒理學8個學科進入ESI全球前1%。
學校緊密圍繞國家戰略和區域重大需求，深入實施創新驅動發展戰略，以深化科研體制機制改革為動力，強化基礎研究和應用研究，促進科技成果轉化，發揮大綜合、強應用的學科優勢，堅持產學研一體化道路，在“荒漠綠洲區高效農業與生態、動物遺傳改良與疾病控制、新疆地方與民族高發病防治、新疆農產品高效貯藏與深加工、新疆特種植物藥資源與開發、化工綠色工藝及新型材料技術、新疆特色農業生產機械化技術與裝備、干旱區節水灌溉理論與技術、新疆生物資源保護與利用、空間信息技術與3S應用、新疆綠洲經濟社會發展、新疆非物質文化遺產、中亞教育與人文交流、新疆少數民族教育發展與教育政策”等具有區位優勢和特色的研究領域取得了突破性進展。
近五年來，學校主動承擔國家、兵團重大科研任務，立項各級各類項目2703項，科研總經費近10.53億元。獲省部級以上獎勵32項，獲授權有效專利1424件，以技術轉讓、技術開發等形式實施知識產權成果轉化40件，技術交易額4900余萬元。獲教育部高等學?？茖W研究優秀成果獎（人文社會科學）三等獎2項，36項成果獲得自治區哲學社會優秀成果獎，其中一等獎5項、二等獎4項、三等獎8項、優秀獎19項，獲獎數居新疆高校前列。
學校面向全國31個?。ㄊ?、區）招生，現有在校學生32721人，其中普通本科生23229人、普通?？粕?16人，碩士、博士研究生8493人，留學生483人。有國家一流本科課程18門，省級一流本科課程75門。有國家級教學團隊3個，國家級教學名師2人。作為第一完成單位獲國家級教學成果二等獎5項，作為參與單位獲國家級教學成果一等獎1項、二等獎3項。獲批國家級實驗教學示范中心1個，教育部第二批虛擬教研室建設試點項目2個。2門本科課程及其課程團隊獲評教育部課程思政示范課程、課程思政教學名師和團隊，33門課程獲批省級課程思政示范課，馬克思主義學院入選全國重點培育單位。學校是國家級創新創業教育實踐基地建設單位，學生獲中國國際大學生創新大賽金獎5項、“挑戰杯”全國大學生課外學術科技作品競賽一等獎4項、世界學生圍棋王座戰冠軍1項。學校是教育部卓越（醫生、工程師、農林人才）教育培養計劃項目試點高校，設有6個卓越人才培養計劃項目試點專業。學校堅持繼承和弘揚中華優秀傳統文化，依托國家大學生文化素質教育基地，積極構建特色鮮明的文化素質教育體系。設有繼續教育學院，現有成人學生12109人。有臨床教學醫院8所，其中第一附屬醫院是國家住院醫師規范化培訓基地和國家住培全科重點專業基地，兵團唯一住培結業考核基地，擁有國家級臨床重點?？?個、國家臨床重點?？平ㄔO項目1個、兵團臨床重點?？?5個。
學?，F有院士工作站2個，省部共建國家重點實驗室培育基地2個，教育部重點實驗室2個，農業農村部重點實驗室2個，衛生與健康委員會重點實驗室1個，科技部國際科技合作基地3個，教育部工程研究中心3個，教育部省部共建協同創新中心3個，發改委國家地方聯合工程研究中心（實驗室）3個，國家臨床醫學研究中心兵團分中心3個，國家大學科技園1個，國家新農村發展研究院1個，兵團重點實驗室14個，兵團協同創新中心4個，兵團工程技術研究中心（工程實驗室）5個，兵團國際科技合作基地3個，兵團技術創新中心4個，兵團臨床醫學研究中心17個，高等學校學科創新引智基地（“111”計劃）1個，國家民委研究中心（基地）2個，自治區和兵團文科重點研究基地7個，兵團新型科技創新智庫2個。
學?，F有教職工2803人，專任教師2080人（教授424人、副教授841人）?，F有中國工程院院士4人，入選國家人才項目45人次，國務院特貼專家78人，全國高校黃大年式教師團隊2個，自治區、兵團級人才370人。
學校廣泛開展對外交流與合作，成立國際交流中心，在哈薩克斯坦建立孔子學院，在俄羅斯和哈薩克斯坦分別建立一所漢語中心。先后與美國、俄羅斯、哈薩克斯坦、新西蘭、奧地利、日本等國家70余所大學和科研機構開展了多層次、寬領域的交流合作，先后有34個國家1430余人來校留學。
學校積極拓展校際、校地、校企交流合作。自2001年開始，北京大學長期堅持對口支援石河子大學；2010年新一輪對口支援工作開展以來，在教育部大力支持下，以北京大學為組長單位，華中科技大學、華東理工大學、華中農業大學為副組長單位，重慶大學、江南大學、對外經濟貿易大學、南京師范大學、華南農業大學為成員單位的高校團隊對口支援石河子大學。2018年，中國農業大學對口援建我校農業工程學科。學校先后與30余所國內高校及科研院所達成合作意向；與自治區各級政府、兵團師市簽訂了合作協議50余個；與30余家企業建立了校企合作關系。
學校擁有良好的教學、科研條件。綠化覆蓋率41％。擁有設施完善的圖書館、體育館、游泳館、田徑館、標準體育場、會堂、綜合教學樓、博物館等一批標志性建筑。
（數據截至2024年11月）
